Административно Прешовский край разделен на 13 районов:
В Прешовском крае имеется 666 муниципальных образований, из которых 23 имеют статус города. По количеству населения Прешовский край сохраняет первенство во всей Словакии. Плотность населения в крае вторая наименьшая среди всех краёв Словакии. В городах проживает почти 50% населения края. Административным центром края является третий по величине город Словакии Прешов (91767 человек).